Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COPS9Q8WXC6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPS9Q8WXC6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS9Q8WXC6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPS9Q8WXC6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms