Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD6

CHPT1, Cholinephosphotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPT1Q8WUD6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHPT1Q8WUD6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHPT1Q8WUD6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHPT1Q8WUD6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHPT1Q8WUD6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHPT1Q8WUD6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHPT1Q8WUD6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHPT1Q8WUD6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHPT1Q8WUD6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPT1Q8WUD6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHPT1Q8WUD6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPT1Q8WUD6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPT1Q8WUD6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPT1Q8WUD6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPT1Q8WUD6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHPT1Q8WUD6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPT1Q8WUD6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPT1Q8WUD6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPT1Q8WUD6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHPT1Q8WUD6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHPT1Q8WUD6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPT1Q8WUD6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPT1Q8WUD6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPT1Q8WUD6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPT1Q8WUD6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPT1Q8WUD6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPT1Q8WUD6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPT1Q8WUD6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPT1Q8WUD6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPT1Q8WUD6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHPT1Q8WUD6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHPT1Q8WUD6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHPT1Q8WUD6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHPT1Q8WUD6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHPT1Q8WUD6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPT1Q8WUD6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPT1Q8WUD6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPT1Q8WUD6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHPT1Q8WUD6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHPT1Q8WUD6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHPT1Q8WUD6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHPT1Q8WUD6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPT1Q8WUD6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPT1Q8WUD6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPT1Q8WUD6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPT1Q8WUD6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPT1Q8WUD6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPT1Q8WUD6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPT1Q8WUD6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPT1Q8WUD6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPT1Q8WUD6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPT1Q8WUD6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPT1Q8WUD6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPT1Q8WUD6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPT1Q8WUD6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPT1Q8WUD6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPT1Q8WUD6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CHPT1Q8WUD6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHPT1Q8WUD6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHPT1Q8WUD6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPT1Q8WUD6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPT1Q8WUD6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPT1Q8WUD6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPT1Q8WUD6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPT1Q8WUD6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHPT1Q8WUD6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPT1Q8WUD6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPT1Q8WUD6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPT1Q8WUD6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPT1Q8WUD6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHPT1Q8WUD6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPT1Q8WUD6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHPT1Q8WUD6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms