Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR2

STK35, Serine/threonine-protein kinase 35, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STK35Q8TDR2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STK35Q8TDR2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STK35Q8TDR2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STK35Q8TDR2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STK35Q8TDR2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STK35Q8TDR2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
STK35Q8TDR2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STK35Q8TDR2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
STK35Q8TDR2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STK35Q8TDR2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STK35Q8TDR2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STK35Q8TDR2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STK35Q8TDR2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STK35Q8TDR2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STK35Q8TDR2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
STK35Q8TDR2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STK35Q8TDR2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STK35Q8TDR2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STK35Q8TDR2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STK35Q8TDR2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STK35Q8TDR2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STK35Q8TDR2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms