Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF3IP1Q8TDR0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAF3IP1Q8TDR0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAF3IP1Q8TDR0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAF3IP1Q8TDR0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAF3IP1Q8TDR0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAF3IP1Q8TDR0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAF3IP1Q8TDR0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAF3IP1Q8TDR0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAF3IP1Q8TDR0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAF3IP1Q8TDR0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF3IP1Q8TDR0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF3IP1Q8TDR0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF3IP1Q8TDR0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF3IP1Q8TDR0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAF3IP1Q8TDR0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAF3IP1Q8TDR0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAF3IP1Q8TDR0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAF3IP1Q8TDR0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAF3IP1Q8TDR0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAF3IP1Q8TDR0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAF3IP1Q8TDR0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAF3IP1Q8TDR0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAF3IP1Q8TDR0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAF3IP1Q8TDR0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF3IP1Q8TDR0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAF3IP1Q8TDR0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAF3IP1Q8TDR0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAF3IP1Q8TDR0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAF3IP1Q8TDR0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAF3IP1Q8TDR0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAF3IP1Q8TDR0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAF3IP1Q8TDR0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAF3IP1Q8TDR0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAF3IP1Q8TDR0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAF3IP1Q8TDR0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAF3IP1Q8TDR0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAF3IP1Q8TDR0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAF3IP1Q8TDR0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAF3IP1Q8TDR0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAF3IP1Q8TDR0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAF3IP1Q8TDR0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAF3IP1Q8TDR0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF3IP1Q8TDR0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms