Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMO3Q8TAP4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMO3Q8TAP4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMO3Q8TAP4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMO3Q8TAP4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMO3Q8TAP4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMO3Q8TAP4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMO3Q8TAP4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LMO3Q8TAP4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LMO3Q8TAP4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMO3Q8TAP4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMO3Q8TAP4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMO3Q8TAP4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMO3Q8TAP4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMO3Q8TAP4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMO3Q8TAP4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMO3Q8TAP4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMO3Q8TAP4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMO3Q8TAP4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMO3Q8TAP4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMO3Q8TAP4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LMO3Q8TAP4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
LMO3Q8TAP4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMO3Q8TAP4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LMO3Q8TAP4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LMO3Q8TAP4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMO3Q8TAP4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMO3Q8TAP4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMO3Q8TAP4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMO3Q8TAP4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMO3Q8TAP4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMO3Q8TAP4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMO3Q8TAP4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LMO3Q8TAP4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO3Q8TAP4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO3Q8TAP4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO3Q8TAP4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO3Q8TAP4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMO3Q8TAP4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMO3Q8TAP4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
LMO3Q8TAP4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMO3Q8TAP4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
LMO3Q8TAP4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMO3Q8TAP4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMO3Q8TAP4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMO3Q8TAP4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMO3Q8TAP4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMO3Q8TAP4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMO3Q8TAP4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMO3Q8TAP4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMO3Q8TAP4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LMO3Q8TAP4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMO3Q8TAP4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMO3Q8TAP4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMO3Q8TAP4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMO3Q8TAP4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMO3Q8TAP4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMO3Q8TAP4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMO3Q8TAP4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMO3Q8TAP4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMO3Q8TAP4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMO3Q8TAP4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMO3Q8TAP4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMO3Q8TAP4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMO3Q8TAP4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO3Q8TAP4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMO3Q8TAP4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMO3Q8TAP4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMO3Q8TAP4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMO3Q8TAP4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMO3Q8TAP4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMO3Q8TAP4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms