Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC148Q8NFR7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC148Q8NFR7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC148Q8NFR7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC148Q8NFR7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC148Q8NFR7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC148Q8NFR7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC148Q8NFR7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC148Q8NFR7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC148Q8NFR7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC148Q8NFR7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC148Q8NFR7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC148Q8NFR7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC148Q8NFR7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC148Q8NFR7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC148Q8NFR7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC148Q8NFR7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC148Q8NFR7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC148Q8NFR7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
CCDC148Q8NFR7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC148Q8NFR7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC148Q8NFR7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC148Q8NFR7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC148Q8NFR7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC148Q8NFR7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC148Q8NFR7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC148Q8NFR7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC148Q8NFR7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC148Q8NFR7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC148Q8NFR7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC148Q8NFR7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC148Q8NFR7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC148Q8NFR7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC148Q8NFR7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC148Q8NFR7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC148Q8NFR7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC148Q8NFR7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC148Q8NFR7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC148Q8NFR7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC148Q8NFR7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC148Q8NFR7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms