Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LINC00116Q8NCU8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LINC00116Q8NCU8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LINC00116Q8NCU8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LINC00116Q8NCU8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LINC00116Q8NCU8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LINC00116Q8NCU8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LINC00116Q8NCU8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
LINC00116Q8NCU8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LINC00116Q8NCU8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LINC00116Q8NCU8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LINC00116Q8NCU8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LINC00116Q8NCU8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LINC00116Q8NCU8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LINC00116Q8NCU8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LINC00116Q8NCU8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LINC00116Q8NCU8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LINC00116Q8NCU8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LINC00116Q8NCU8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LINC00116Q8NCU8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LINC00116Q8NCU8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LINC00116Q8NCU8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LINC00116Q8NCU8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LINC00116Q8NCU8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LINC00116Q8NCU8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LINC00116Q8NCU8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LINC00116Q8NCU8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LINC00116Q8NCU8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LINC00116Q8NCU8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LINC00116Q8NCU8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LINC00116Q8NCU8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
LINC00116Q8NCU8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LINC00116Q8NCU8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LINC00116Q8NCU8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
LINC00116Q8NCU8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LINC00116Q8NCU8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LINC00116Q8NCU8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LINC00116Q8NCU8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
LINC00116Q8NCU8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
LINC00116Q8NCU8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
LINC00116Q8NCU8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LINC00116Q8NCU8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
LINC00116Q8NCU8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LINC00116Q8NCU8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
LINC00116Q8NCU8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LINC00116Q8NCU8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LINC00116Q8NCU8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LINC00116Q8NCU8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LINC00116Q8NCU8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LINC00116Q8NCU8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LINC00116Q8NCU8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LINC00116Q8NCU8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LINC00116Q8NCU8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LINC00116Q8NCU8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LINC00116Q8NCU8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LINC00116Q8NCU8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
LINC00116Q8NCU8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LINC00116Q8NCU8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LINC00116Q8NCU8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LINC00116Q8NCU8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LINC00116Q8NCU8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LINC00116Q8NCU8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LINC00116Q8NCU8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LINC00116Q8NCU8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LINC00116Q8NCU8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LINC00116Q8NCU8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LINC00116Q8NCU8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LINC00116Q8NCU8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LINC00116Q8NCU8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LINC00116Q8NCU8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LINC00116Q8NCU8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LINC00116Q8NCU8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LINC00116Q8NCU8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LINC00116Q8NCU8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LINC00116Q8NCU8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LINC00116Q8NCU8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
LINC00116Q8NCU8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LINC00116Q8NCU8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LINC00116Q8NCU8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LINC00116Q8NCU8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms