Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARRDC4Q8NCT1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARRDC4Q8NCT1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARRDC4Q8NCT1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARRDC4Q8NCT1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARRDC4Q8NCT1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARRDC4Q8NCT1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARRDC4Q8NCT1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARRDC4Q8NCT1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARRDC4Q8NCT1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARRDC4Q8NCT1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARRDC4Q8NCT1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARRDC4Q8NCT1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARRDC4Q8NCT1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARRDC4Q8NCT1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARRDC4Q8NCT1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARRDC4Q8NCT1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARRDC4Q8NCT1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ARRDC4Q8NCT1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ARRDC4Q8NCT1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARRDC4Q8NCT1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARRDC4Q8NCT1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARRDC4Q8NCT1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARRDC4Q8NCT1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARRDC4Q8NCT1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARRDC4Q8NCT1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARRDC4Q8NCT1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARRDC4Q8NCT1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARRDC4Q8NCT1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARRDC4Q8NCT1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARRDC4Q8NCT1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARRDC4Q8NCT1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARRDC4Q8NCT1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ARRDC4Q8NCT1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARRDC4Q8NCT1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ARRDC4Q8NCT1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARRDC4Q8NCT1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARRDC4Q8NCT1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARRDC4Q8NCT1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARRDC4Q8NCT1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARRDC4Q8NCT1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ARRDC4Q8NCT1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARRDC4Q8NCT1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARRDC4Q8NCT1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARRDC4Q8NCT1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARRDC4Q8NCT1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARRDC4Q8NCT1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARRDC4Q8NCT1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARRDC4Q8NCT1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARRDC4Q8NCT1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARRDC4Q8NCT1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARRDC4Q8NCT1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARRDC4Q8NCT1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARRDC4Q8NCT1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARRDC4Q8NCT1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARRDC4Q8NCT1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARRDC4Q8NCT1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARRDC4Q8NCT1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARRDC4Q8NCT1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARRDC4Q8NCT1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ARRDC4Q8NCT1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARRDC4Q8NCT1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARRDC4Q8NCT1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ARRDC4Q8NCT1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ARRDC4Q8NCT1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARRDC4Q8NCT1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARRDC4Q8NCT1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARRDC4Q8NCT1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARRDC4Q8NCT1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARRDC4Q8NCT1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARRDC4Q8NCT1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARRDC4Q8NCT1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARRDC4Q8NCT1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARRDC4Q8NCT1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARRDC4Q8NCT1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARRDC4Q8NCT1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARRDC4Q8NCT1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARRDC4Q8NCT1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARRDC4Q8NCT1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARRDC4Q8NCT1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARRDC4Q8NCT1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARRDC4Q8NCT1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARRDC4Q8NCT1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARRDC4Q8NCT1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARRDC4Q8NCT1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARRDC4Q8NCT1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ARRDC4Q8NCT1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ARRDC4Q8NCT1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARRDC4Q8NCT1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARRDC4Q8NCT1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARRDC4Q8NCT1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARRDC4Q8NCT1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARRDC4Q8NCT1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARRDC4Q8NCT1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARRDC4Q8NCT1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARRDC4Q8NCT1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARRDC4Q8NCT1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARRDC4Q8NCT1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARRDC4Q8NCT1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
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