Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP38Q8NB14 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP38Q8NB14 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP38Q8NB14 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP38Q8NB14 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP38Q8NB14 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP38Q8NB14 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP38Q8NB14 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP38Q8NB14 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP38Q8NB14 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP38Q8NB14 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP38Q8NB14 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP38Q8NB14 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP38Q8NB14 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP38Q8NB14 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP38Q8NB14 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP38Q8NB14 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
USP38Q8NB14 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP38Q8NB14 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP38Q8NB14 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP38Q8NB14 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP38Q8NB14 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
USP38Q8NB14 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP38Q8NB14 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP38Q8NB14 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP38Q8NB14 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP38Q8NB14 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
USP38Q8NB14 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP38Q8NB14 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP38Q8NB14 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP38Q8NB14 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP38Q8NB14 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP38Q8NB14 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP38Q8NB14 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP38Q8NB14 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP38Q8NB14 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP38Q8NB14 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP38Q8NB14 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP38Q8NB14 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP38Q8NB14 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP38Q8NB14 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP38Q8NB14 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP38Q8NB14 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP38Q8NB14 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP38Q8NB14 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP38Q8NB14 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP38Q8NB14 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP38Q8NB14 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP38Q8NB14 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP38Q8NB14 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP38Q8NB14 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP38Q8NB14 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP38Q8NB14 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP38Q8NB14 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP38Q8NB14 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP38Q8NB14 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
USP38Q8NB14 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP38Q8NB14 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms