Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSGALNACT2Q8N6G5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSGALNACT2Q8N6G5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSGALNACT2Q8N6G5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSGALNACT2Q8N6G5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CSGALNACT2Q8N6G5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CSGALNACT2Q8N6G5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CSGALNACT2Q8N6G5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CSGALNACT2Q8N6G5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CSGALNACT2Q8N6G5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSGALNACT2Q8N6G5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CSGALNACT2Q8N6G5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSGALNACT2Q8N6G5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSGALNACT2Q8N6G5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CSGALNACT2Q8N6G5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSGALNACT2Q8N6G5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSGALNACT2Q8N6G5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSGALNACT2Q8N6G5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSGALNACT2Q8N6G5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSGALNACT2Q8N6G5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSGALNACT2Q8N6G5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSGALNACT2Q8N6G5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSGALNACT2Q8N6G5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSGALNACT2Q8N6G5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CSGALNACT2Q8N6G5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSGALNACT2Q8N6G5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSGALNACT2Q8N6G5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CSGALNACT2Q8N6G5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSGALNACT2Q8N6G5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSGALNACT2Q8N6G5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSGALNACT2Q8N6G5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSGALNACT2Q8N6G5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSGALNACT2Q8N6G5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSGALNACT2Q8N6G5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSGALNACT2Q8N6G5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSGALNACT2Q8N6G5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSGALNACT2Q8N6G5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSGALNACT2Q8N6G5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSGALNACT2Q8N6G5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CSGALNACT2Q8N6G5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSGALNACT2Q8N6G5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSGALNACT2Q8N6G5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CSGALNACT2Q8N6G5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSGALNACT2Q8N6G5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CSGALNACT2Q8N6G5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms