Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHCHD4Q8N4Q1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHCHD4Q8N4Q1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHCHD4Q8N4Q1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHCHD4Q8N4Q1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHCHD4Q8N4Q1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHCHD4Q8N4Q1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHCHD4Q8N4Q1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHCHD4Q8N4Q1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHCHD4Q8N4Q1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHCHD4Q8N4Q1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHCHD4Q8N4Q1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHCHD4Q8N4Q1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHCHD4Q8N4Q1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHCHD4Q8N4Q1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHCHD4Q8N4Q1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHCHD4Q8N4Q1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHCHD4Q8N4Q1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHCHD4Q8N4Q1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHCHD4Q8N4Q1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHCHD4Q8N4Q1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHCHD4Q8N4Q1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHCHD4Q8N4Q1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHCHD4Q8N4Q1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHCHD4Q8N4Q1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHCHD4Q8N4Q1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHCHD4Q8N4Q1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHCHD4Q8N4Q1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHCHD4Q8N4Q1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHCHD4Q8N4Q1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHCHD4Q8N4Q1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHCHD4Q8N4Q1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHCHD4Q8N4Q1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHCHD4Q8N4Q1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHCHD4Q8N4Q1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHCHD4Q8N4Q1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHCHD4Q8N4Q1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHCHD4Q8N4Q1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
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