Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFRP1Q8N474 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFRP1Q8N474 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFRP1Q8N474 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFRP1Q8N474 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFRP1Q8N474 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFRP1Q8N474 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFRP1Q8N474 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFRP1Q8N474 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SFRP1Q8N474 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SFRP1Q8N474 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SFRP1Q8N474 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFRP1Q8N474 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFRP1Q8N474 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFRP1Q8N474 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFRP1Q8N474 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFRP1Q8N474 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SFRP1Q8N474 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFRP1Q8N474 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFRP1Q8N474 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFRP1Q8N474 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SFRP1Q8N474 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFRP1Q8N474 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFRP1Q8N474 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFRP1Q8N474 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFRP1Q8N474 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFRP1Q8N474 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFRP1Q8N474 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFRP1Q8N474 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFRP1Q8N474 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFRP1Q8N474 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFRP1Q8N474 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFRP1Q8N474 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFRP1Q8N474 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFRP1Q8N474 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFRP1Q8N474 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFRP1Q8N474 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SFRP1Q8N474 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SFRP1Q8N474 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SFRP1Q8N474 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFRP1Q8N474 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFRP1Q8N474 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFRP1Q8N474 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFRP1Q8N474 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFRP1Q8N474 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SFRP1Q8N474 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFRP1Q8N474 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFRP1Q8N474 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFRP1Q8N474 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFRP1Q8N474 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFRP1Q8N474 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFRP1Q8N474 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFRP1Q8N474 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFRP1Q8N474 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFRP1Q8N474 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFRP1Q8N474 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SFRP1Q8N474 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SFRP1Q8N474 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SFRP1Q8N474 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFRP1Q8N474 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFRP1Q8N474 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SFRP1Q8N474 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFRP1Q8N474 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFRP1Q8N474 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFRP1Q8N474 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFRP1Q8N474 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SFRP1Q8N474 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms