Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2K1

UBE2J2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J2Q8N2K1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2J2Q8N2K1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2J2Q8N2K1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2J2Q8N2K1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2J2Q8N2K1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms