Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PROM2Q8N271 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PROM2Q8N271 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PROM2Q8N271 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PROM2Q8N271 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PROM2Q8N271 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PROM2Q8N271 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PROM2Q8N271 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PROM2Q8N271 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PROM2Q8N271 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PROM2Q8N271 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PROM2Q8N271 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
PROM2Q8N271 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PROM2Q8N271 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PROM2Q8N271 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PROM2Q8N271 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PROM2Q8N271 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PROM2Q8N271 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PROM2Q8N271 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PROM2Q8N271 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PROM2Q8N271 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PROM2Q8N271 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PROM2Q8N271 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PROM2Q8N271 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PROM2Q8N271 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PROM2Q8N271 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PROM2Q8N271 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PROM2Q8N271 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
PROM2Q8N271 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PROM2Q8N271 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PROM2Q8N271 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PROM2Q8N271 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PROM2Q8N271 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PROM2Q8N271 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PROM2Q8N271 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PROM2Q8N271 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PROM2Q8N271 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PROM2Q8N271 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PROM2Q8N271 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PROM2Q8N271 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PROM2Q8N271 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PROM2Q8N271 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PROM2Q8N271 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PROM2Q8N271 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PROM2Q8N271 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PROM2Q8N271 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PROM2Q8N271 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PROM2Q8N271 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PROM2Q8N271 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PROM2Q8N271 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PROM2Q8N271 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PROM2Q8N271 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PROM2Q8N271 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PROM2Q8N271 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PROM2Q8N271 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PROM2Q8N271 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PROM2Q8N271 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PROM2Q8N271 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PROM2Q8N271 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PROM2Q8N271 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PROM2Q8N271 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PROM2Q8N271 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PROM2Q8N271 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PROM2Q8N271 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PROM2Q8N271 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PROM2Q8N271 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PROM2Q8N271 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PROM2Q8N271 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PROM2Q8N271 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PROM2Q8N271 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PROM2Q8N271 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PROM2Q8N271 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PROM2Q8N271 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PROM2Q8N271 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PROM2Q8N271 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PROM2Q8N271 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PROM2Q8N271 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PROM2Q8N271 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PROM2Q8N271 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PROM2Q8N271 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PROM2Q8N271 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PROM2Q8N271 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PROM2Q8N271 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PROM2Q8N271 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PROM2Q8N271 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PROM2Q8N271 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PROM2Q8N271 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PROM2Q8N271 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PROM2Q8N271 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PROM2Q8N271 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PROM2Q8N271 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PROM2Q8N271 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PROM2Q8N271 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PROM2Q8N271 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PROM2Q8N271 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PROM2Q8N271 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PROM2Q8N271 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PROM2Q8N271 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PROM2Q8N271 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PROM2Q8N271 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms