Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGI4Q8N135 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGI4Q8N135 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LGI4Q8N135 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LGI4Q8N135 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGI4Q8N135 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms