Protein–RNA interactions for Protein: Q86T82

USP37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP37Q86T82 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP37Q86T82 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP37Q86T82 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP37Q86T82 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP37Q86T82 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP37Q86T82 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP37Q86T82 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP37Q86T82 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP37Q86T82 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP37Q86T82 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP37Q86T82 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP37Q86T82 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP37Q86T82 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP37Q86T82 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP37Q86T82 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
USP37Q86T82 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP37Q86T82 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP37Q86T82 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP37Q86T82 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP37Q86T82 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP37Q86T82 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP37Q86T82 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP37Q86T82 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP37Q86T82 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP37Q86T82 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
USP37Q86T82 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP37Q86T82 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP37Q86T82 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP37Q86T82 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP37Q86T82 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP37Q86T82 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP37Q86T82 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP37Q86T82 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP37Q86T82 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
USP37Q86T82 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP37Q86T82 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP37Q86T82 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP37Q86T82 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP37Q86T82 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP37Q86T82 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP37Q86T82 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP37Q86T82 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP37Q86T82 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP37Q86T82 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP37Q86T82 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP37Q86T82 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms