Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5N4

SDK1, Protein sidekick-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK1Q7Z5N4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDK1Q7Z5N4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDK1Q7Z5N4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDK1Q7Z5N4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDK1Q7Z5N4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDK1Q7Z5N4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDK1Q7Z5N4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SDK1Q7Z5N4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SDK1Q7Z5N4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDK1Q7Z5N4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDK1Q7Z5N4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDK1Q7Z5N4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDK1Q7Z5N4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDK1Q7Z5N4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SDK1Q7Z5N4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDK1Q7Z5N4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDK1Q7Z5N4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SDK1Q7Z5N4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDK1Q7Z5N4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDK1Q7Z5N4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDK1Q7Z5N4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SDK1Q7Z5N4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDK1Q7Z5N4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDK1Q7Z5N4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SDK1Q7Z5N4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDK1Q7Z5N4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDK1Q7Z5N4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SDK1Q7Z5N4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDK1Q7Z5N4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDK1Q7Z5N4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SDK1Q7Z5N4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDK1Q7Z5N4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SDK1Q7Z5N4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDK1Q7Z5N4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SDK1Q7Z5N4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDK1Q7Z5N4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SDK1Q7Z5N4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDK1Q7Z5N4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SDK1Q7Z5N4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDK1Q7Z5N4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDK1Q7Z5N4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SDK1Q7Z5N4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDK1Q7Z5N4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDK1Q7Z5N4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDK1Q7Z5N4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDK1Q7Z5N4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDK1Q7Z5N4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDK1Q7Z5N4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDK1Q7Z5N4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDK1Q7Z5N4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDK1Q7Z5N4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDK1Q7Z5N4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDK1Q7Z5N4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SDK1Q7Z5N4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDK1Q7Z5N4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDK1Q7Z5N4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDK1Q7Z5N4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDK1Q7Z5N4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDK1Q7Z5N4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SDK1Q7Z5N4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SDK1Q7Z5N4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDK1Q7Z5N4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDK1Q7Z5N4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDK1Q7Z5N4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDK1Q7Z5N4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDK1Q7Z5N4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDK1Q7Z5N4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDK1Q7Z5N4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDK1Q7Z5N4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDK1Q7Z5N4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDK1Q7Z5N4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDK1Q7Z5N4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDK1Q7Z5N4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDK1Q7Z5N4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDK1Q7Z5N4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDK1Q7Z5N4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDK1Q7Z5N4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDK1Q7Z5N4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDK1Q7Z5N4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms