Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z442

PKD1L2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L2Q7Z442 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD1L2Q7Z442 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD1L2Q7Z442 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD1L2Q7Z442 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD1L2Q7Z442 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD1L2Q7Z442 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD1L2Q7Z442 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD1L2Q7Z442 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD1L2Q7Z442 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD1L2Q7Z442 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD1L2Q7Z442 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD1L2Q7Z442 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD1L2Q7Z442 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD1L2Q7Z442 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD1L2Q7Z442 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD1L2Q7Z442 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD1L2Q7Z442 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD1L2Q7Z442 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PKD1L2Q7Z442 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKD1L2Q7Z442 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKD1L2Q7Z442 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD1L2Q7Z442 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD1L2Q7Z442 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD1L2Q7Z442 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD1L2Q7Z442 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD1L2Q7Z442 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD1L2Q7Z442 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD1L2Q7Z442 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD1L2Q7Z442 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD1L2Q7Z442 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PKD1L2Q7Z442 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD1L2Q7Z442 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD1L2Q7Z442 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD1L2Q7Z442 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD1L2Q7Z442 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD1L2Q7Z442 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKD1L2Q7Z442 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD1L2Q7Z442 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD1L2Q7Z442 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD1L2Q7Z442 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD1L2Q7Z442 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD1L2Q7Z442 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD1L2Q7Z442 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD1L2Q7Z442 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD1L2Q7Z442 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD1L2Q7Z442 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD1L2Q7Z442 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L2Q7Z442 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L2Q7Z442 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L2Q7Z442 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L2Q7Z442 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD1L2Q7Z442 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD1L2Q7Z442 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD1L2Q7Z442 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD1L2Q7Z442 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD1L2Q7Z442 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD1L2Q7Z442 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD1L2Q7Z442 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD1L2Q7Z442 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD1L2Q7Z442 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD1L2Q7Z442 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD1L2Q7Z442 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD1L2Q7Z442 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD1L2Q7Z442 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD1L2Q7Z442 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD1L2Q7Z442 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD1L2Q7Z442 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD1L2Q7Z442 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD1L2Q7Z442 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD1L2Q7Z442 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD1L2Q7Z442 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD1L2Q7Z442 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD1L2Q7Z442 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD1L2Q7Z442 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD1L2Q7Z442 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD1L2Q7Z442 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD1L2Q7Z442 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD1L2Q7Z442 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD1L2Q7Z442 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD1L2Q7Z442 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD1L2Q7Z442 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKD1L2Q7Z442 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKD1L2Q7Z442 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD1L2Q7Z442 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD1L2Q7Z442 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD1L2Q7Z442 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD1L2Q7Z442 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD1L2Q7Z442 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD1L2Q7Z442 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD1L2Q7Z442 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD1L2Q7Z442 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD1L2Q7Z442 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD1L2Q7Z442 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD1L2Q7Z442 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD1L2Q7Z442 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD1L2Q7Z442 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD1L2Q7Z442 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD1L2Q7Z442 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD1L2Q7Z442 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKD1L2Q7Z442 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms