Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP54Q7Z3B4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP54Q7Z3B4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP54Q7Z3B4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUP54Q7Z3B4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP54Q7Z3B4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP54Q7Z3B4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP54Q7Z3B4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP54Q7Z3B4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms