Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC11Q7Z392 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC11Q7Z392 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC11Q7Z392 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC11Q7Z392 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC11Q7Z392 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC11Q7Z392 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC11Q7Z392 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC11Q7Z392 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC11Q7Z392 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC11Q7Z392 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC11Q7Z392 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC11Q7Z392 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRAPPC11Q7Z392 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC11Q7Z392 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC11Q7Z392 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC11Q7Z392 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC11Q7Z392 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC11Q7Z392 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC11Q7Z392 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC11Q7Z392 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC11Q7Z392 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC11Q7Z392 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC11Q7Z392 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC11Q7Z392 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC11Q7Z392 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC11Q7Z392 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC11Q7Z392 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC11Q7Z392 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC11Q7Z392 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC11Q7Z392 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC11Q7Z392 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC11Q7Z392 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC11Q7Z392 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC11Q7Z392 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC11Q7Z392 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC11Q7Z392 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC11Q7Z392 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC11Q7Z392 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC11Q7Z392 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC11Q7Z392 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC11Q7Z392 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC11Q7Z392 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC11Q7Z392 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC11Q7Z392 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC11Q7Z392 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC11Q7Z392 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC11Q7Z392 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC11Q7Z392 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC11Q7Z392 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC11Q7Z392 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRAPPC11Q7Z392 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAPPC11Q7Z392 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC11Q7Z392 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC11Q7Z392 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC11Q7Z392 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC11Q7Z392 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC11Q7Z392 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC11Q7Z392 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC11Q7Z392 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC11Q7Z392 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC11Q7Z392 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC11Q7Z392 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC11Q7Z392 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC11Q7Z392 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC11Q7Z392 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC11Q7Z392 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC11Q7Z392 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC11Q7Z392 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC11Q7Z392 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC11Q7Z392 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC11Q7Z392 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC11Q7Z392 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC11Q7Z392 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC11Q7Z392 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC11Q7Z392 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC11Q7Z392 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms