Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
OTOP3Q7RTS5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOP3Q7RTS5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOP3Q7RTS5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOP3Q7RTS5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOP3Q7RTS5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
OTOP3Q7RTS5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
OTOP3Q7RTS5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
OTOP3Q7RTS5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
OTOP3Q7RTS5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
OTOP3Q7RTS5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
OTOP3Q7RTS5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP3Q7RTS5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP3Q7RTS5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP3Q7RTS5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP3Q7RTS5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP3Q7RTS5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP3Q7RTS5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP3Q7RTS5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP3Q7RTS5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP3Q7RTS5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
OTOP3Q7RTS5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
OTOP3Q7RTS5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
OTOP3Q7RTS5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
OTOP3Q7RTS5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
OTOP3Q7RTS5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.52■■■□□ 2
OTOP3Q7RTS5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTOP3Q7RTS5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTOP3Q7RTS5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTOP3Q7RTS5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTOP3Q7RTS5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTOP3Q7RTS5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
OTOP3Q7RTS5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OTOP3Q7RTS5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
OTOP3Q7RTS5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTOP3Q7RTS5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
OTOP3Q7RTS5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
OTOP3Q7RTS5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
OTOP3Q7RTS5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
OTOP3Q7RTS5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
OTOP3Q7RTS5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTOP3Q7RTS5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTOP3Q7RTS5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTOP3Q7RTS5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTOP3Q7RTS5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTOP3Q7RTS5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTOP3Q7RTS5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTOP3Q7RTS5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTOP3Q7RTS5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTOP3Q7RTS5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTOP3Q7RTS5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTOP3Q7RTS5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTOP3Q7RTS5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms