Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RTL4Q6ZR62 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTL4Q6ZR62 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL4Q6ZR62 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL4Q6ZR62 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTL4Q6ZR62 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL4Q6ZR62 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL4Q6ZR62 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL4Q6ZR62 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL4Q6ZR62 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL4Q6ZR62 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTL4Q6ZR62 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL4Q6ZR62 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTL4Q6ZR62 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL4Q6ZR62 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL4Q6ZR62 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL4Q6ZR62 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL4Q6ZR62 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL4Q6ZR62 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL4Q6ZR62 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTL4Q6ZR62 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTL4Q6ZR62 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTL4Q6ZR62 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTL4Q6ZR62 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTL4Q6ZR62 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTL4Q6ZR62 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTL4Q6ZR62 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTL4Q6ZR62 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTL4Q6ZR62 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTL4Q6ZR62 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTL4Q6ZR62 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTL4Q6ZR62 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTL4Q6ZR62 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTL4Q6ZR62 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTL4Q6ZR62 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTL4Q6ZR62 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTL4Q6ZR62 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTL4Q6ZR62 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTL4Q6ZR62 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTL4Q6ZR62 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTL4Q6ZR62 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTL4Q6ZR62 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RTL4Q6ZR62 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTL4Q6ZR62 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTL4Q6ZR62 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTL4Q6ZR62 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTL4Q6ZR62 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTL4Q6ZR62 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTL4Q6ZR62 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTL4Q6ZR62 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTL4Q6ZR62 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTL4Q6ZR62 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTL4Q6ZR62 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTL4Q6ZR62 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTL4Q6ZR62 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTL4Q6ZR62 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTL4Q6ZR62 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTL4Q6ZR62 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTL4Q6ZR62 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms