Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TXNDC11Q6PKC3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TXNDC11Q6PKC3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TXNDC11Q6PKC3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TXNDC11Q6PKC3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TXNDC11Q6PKC3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TXNDC11Q6PKC3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TXNDC11Q6PKC3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TXNDC11Q6PKC3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TXNDC11Q6PKC3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TXNDC11Q6PKC3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TXNDC11Q6PKC3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TXNDC11Q6PKC3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TXNDC11Q6PKC3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TXNDC11Q6PKC3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TXNDC11Q6PKC3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TXNDC11Q6PKC3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TXNDC11Q6PKC3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TXNDC11Q6PKC3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TXNDC11Q6PKC3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TXNDC11Q6PKC3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TXNDC11Q6PKC3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNDC11Q6PKC3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNDC11Q6PKC3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TXNDC11Q6PKC3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNDC11Q6PKC3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNDC11Q6PKC3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TXNDC11Q6PKC3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNDC11Q6PKC3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TXNDC11Q6PKC3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNDC11Q6PKC3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNDC11Q6PKC3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNDC11Q6PKC3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNDC11Q6PKC3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TXNDC11Q6PKC3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNDC11Q6PKC3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNDC11Q6PKC3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms