Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBA3EQ6PEY2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBA3EQ6PEY2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA3EQ6PEY2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA3EQ6PEY2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA3EQ6PEY2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBA3EQ6PEY2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBA3EQ6PEY2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA3EQ6PEY2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA3EQ6PEY2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA3EQ6PEY2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBA3EQ6PEY2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBA3EQ6PEY2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBA3EQ6PEY2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBA3EQ6PEY2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBA3EQ6PEY2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBA3EQ6PEY2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBA3EQ6PEY2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBA3EQ6PEY2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBA3EQ6PEY2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBA3EQ6PEY2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA3EQ6PEY2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms