Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUS6

TCTN3, Tectonic-3, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN3Q6NUS6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCTN3Q6NUS6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TCTN3Q6NUS6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCTN3Q6NUS6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCTN3Q6NUS6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCTN3Q6NUS6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCTN3Q6NUS6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCTN3Q6NUS6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCTN3Q6NUS6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TCTN3Q6NUS6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCTN3Q6NUS6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCTN3Q6NUS6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCTN3Q6NUS6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCTN3Q6NUS6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCTN3Q6NUS6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCTN3Q6NUS6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCTN3Q6NUS6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCTN3Q6NUS6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCTN3Q6NUS6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCTN3Q6NUS6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCTN3Q6NUS6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCTN3Q6NUS6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCTN3Q6NUS6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCTN3Q6NUS6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCTN3Q6NUS6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms