Protein–RNA interactions for Protein: Q6IA17

SIGIRR, Single Ig IL-1-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGIRRQ6IA17 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIGIRRQ6IA17 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIGIRRQ6IA17 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIGIRRQ6IA17 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIGIRRQ6IA17 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIGIRRQ6IA17 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIGIRRQ6IA17 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIGIRRQ6IA17 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIGIRRQ6IA17 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIGIRRQ6IA17 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIGIRRQ6IA17 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIGIRRQ6IA17 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIGIRRQ6IA17 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIGIRRQ6IA17 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIGIRRQ6IA17 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIGIRRQ6IA17 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIGIRRQ6IA17 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIGIRRQ6IA17 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIGIRRQ6IA17 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIGIRRQ6IA17 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIGIRRQ6IA17 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIGIRRQ6IA17 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIGIRRQ6IA17 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIGIRRQ6IA17 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIGIRRQ6IA17 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIGIRRQ6IA17 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIGIRRQ6IA17 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIGIRRQ6IA17 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SIGIRRQ6IA17 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIGIRRQ6IA17 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIGIRRQ6IA17 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIGIRRQ6IA17 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIGIRRQ6IA17 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms