Protein–RNA interactions for Protein: Q5W186

CST9, Cystatin-9, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST9Q5W186 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CST9Q5W186 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CST9Q5W186 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CST9Q5W186 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CST9Q5W186 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CST9Q5W186 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CST9Q5W186 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CST9Q5W186 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CST9Q5W186 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CST9Q5W186 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CST9Q5W186 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CST9Q5W186 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CST9Q5W186 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CST9Q5W186 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CST9Q5W186 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CST9Q5W186 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CST9Q5W186 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CST9Q5W186 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CST9Q5W186 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CST9Q5W186 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CST9Q5W186 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CST9Q5W186 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CST9Q5W186 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CST9Q5W186 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CST9Q5W186 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CST9Q5W186 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CST9Q5W186 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CST9Q5W186 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CST9Q5W186 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CST9Q5W186 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
CST9Q5W186 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CST9Q5W186 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CST9Q5W186 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CST9Q5W186 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CST9Q5W186 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
CST9Q5W186 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CST9Q5W186 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CST9Q5W186 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CST9Q5W186 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CST9Q5W186 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CST9Q5W186 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CST9Q5W186 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CST9Q5W186 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CST9Q5W186 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CST9Q5W186 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CST9Q5W186 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CST9Q5W186 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CST9Q5W186 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CST9Q5W186 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CST9Q5W186 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CST9Q5W186 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CST9Q5W186 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
CST9Q5W186 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CST9Q5W186 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CST9Q5W186 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CST9Q5W186 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CST9Q5W186 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CST9Q5W186 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CST9Q5W186 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CST9Q5W186 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CST9Q5W186 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CST9Q5W186 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CST9Q5W186 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CST9Q5W186 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CST9Q5W186 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CST9Q5W186 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CST9Q5W186 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CST9Q5W186 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CST9Q5W186 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CST9Q5W186 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CST9Q5W186 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CST9Q5W186 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CST9Q5W186 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CST9Q5W186 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CST9Q5W186 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CST9Q5W186 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CST9Q5W186 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CST9Q5W186 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CST9Q5W186 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CST9Q5W186 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CST9Q5W186 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CST9Q5W186 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CST9Q5W186 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CST9Q5W186 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CST9Q5W186 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CST9Q5W186 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CST9Q5W186 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CST9Q5W186 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CST9Q5W186 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CST9Q5W186 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CST9Q5W186 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CST9Q5W186 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CST9Q5W186 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CST9Q5W186 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CST9Q5W186 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CST9Q5W186 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CST9Q5W186 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CST9Q5W186 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CST9Q5W186 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CST9Q5W186 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms