Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYM1

C9orf131, Uncharacterized protein C9orf131, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf131Q5VYM1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
C9orf131Q5VYM1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
C9orf131Q5VYM1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
C9orf131Q5VYM1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
C9orf131Q5VYM1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
C9orf131Q5VYM1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
C9orf131Q5VYM1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
C9orf131Q5VYM1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
C9orf131Q5VYM1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
C9orf131Q5VYM1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
C9orf131Q5VYM1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
C9orf131Q5VYM1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
C9orf131Q5VYM1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
C9orf131Q5VYM1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
C9orf131Q5VYM1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
C9orf131Q5VYM1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
C9orf131Q5VYM1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
C9orf131Q5VYM1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
C9orf131Q5VYM1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
C9orf131Q5VYM1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
C9orf131Q5VYM1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
C9orf131Q5VYM1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
C9orf131Q5VYM1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
C9orf131Q5VYM1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
C9orf131Q5VYM1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
C9orf131Q5VYM1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
C9orf131Q5VYM1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
C9orf131Q5VYM1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
C9orf131Q5VYM1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
C9orf131Q5VYM1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
C9orf131Q5VYM1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
C9orf131Q5VYM1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
C9orf131Q5VYM1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
C9orf131Q5VYM1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
C9orf131Q5VYM1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
C9orf131Q5VYM1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
C9orf131Q5VYM1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
C9orf131Q5VYM1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
C9orf131Q5VYM1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
C9orf131Q5VYM1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
C9orf131Q5VYM1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
C9orf131Q5VYM1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
C9orf131Q5VYM1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
C9orf131Q5VYM1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
C9orf131Q5VYM1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
C9orf131Q5VYM1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
C9orf131Q5VYM1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
C9orf131Q5VYM1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
C9orf131Q5VYM1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
C9orf131Q5VYM1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
C9orf131Q5VYM1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
C9orf131Q5VYM1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
C9orf131Q5VYM1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
C9orf131Q5VYM1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
C9orf131Q5VYM1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
C9orf131Q5VYM1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
C9orf131Q5VYM1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
C9orf131Q5VYM1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
C9orf131Q5VYM1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
C9orf131Q5VYM1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
C9orf131Q5VYM1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
C9orf131Q5VYM1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
C9orf131Q5VYM1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
C9orf131Q5VYM1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
C9orf131Q5VYM1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
C9orf131Q5VYM1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
C9orf131Q5VYM1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
C9orf131Q5VYM1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
C9orf131Q5VYM1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
C9orf131Q5VYM1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
C9orf131Q5VYM1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
C9orf131Q5VYM1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
C9orf131Q5VYM1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
C9orf131Q5VYM1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
C9orf131Q5VYM1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
C9orf131Q5VYM1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
C9orf131Q5VYM1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
C9orf131Q5VYM1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
C9orf131Q5VYM1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
C9orf131Q5VYM1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
C9orf131Q5VYM1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
C9orf131Q5VYM1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
C9orf131Q5VYM1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
C9orf131Q5VYM1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
C9orf131Q5VYM1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
C9orf131Q5VYM1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
C9orf131Q5VYM1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
C9orf131Q5VYM1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
C9orf131Q5VYM1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
C9orf131Q5VYM1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
C9orf131Q5VYM1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
C9orf131Q5VYM1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
C9orf131Q5VYM1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
C9orf131Q5VYM1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
C9orf131Q5VYM1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
C9orf131Q5VYM1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
C9orf131Q5VYM1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
C9orf131Q5VYM1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
C9orf131Q5VYM1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
C9orf131Q5VYM1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms