Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GARNL3Q5VVW2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GARNL3Q5VVW2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GARNL3Q5VVW2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GARNL3Q5VVW2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GARNL3Q5VVW2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GARNL3Q5VVW2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GARNL3Q5VVW2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GARNL3Q5VVW2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GARNL3Q5VVW2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GARNL3Q5VVW2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GARNL3Q5VVW2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GARNL3Q5VVW2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GARNL3Q5VVW2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GARNL3Q5VVW2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GARNL3Q5VVW2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GARNL3Q5VVW2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GARNL3Q5VVW2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GARNL3Q5VVW2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GARNL3Q5VVW2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GARNL3Q5VVW2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GARNL3Q5VVW2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GARNL3Q5VVW2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GARNL3Q5VVW2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms