Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PXDC1Q5TGL8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PXDC1Q5TGL8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PXDC1Q5TGL8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PXDC1Q5TGL8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PXDC1Q5TGL8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PXDC1Q5TGL8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PXDC1Q5TGL8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PXDC1Q5TGL8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PXDC1Q5TGL8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PXDC1Q5TGL8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PXDC1Q5TGL8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PXDC1Q5TGL8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PXDC1Q5TGL8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PXDC1Q5TGL8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PXDC1Q5TGL8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PXDC1Q5TGL8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PXDC1Q5TGL8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PXDC1Q5TGL8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PXDC1Q5TGL8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PXDC1Q5TGL8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PXDC1Q5TGL8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PXDC1Q5TGL8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PXDC1Q5TGL8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms