Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5M9

CCNJ, Cyclin-J, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJQ5T5M9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNJQ5T5M9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNJQ5T5M9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNJQ5T5M9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNJQ5T5M9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNJQ5T5M9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNJQ5T5M9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNJQ5T5M9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNJQ5T5M9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNJQ5T5M9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNJQ5T5M9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNJQ5T5M9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNJQ5T5M9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNJQ5T5M9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNJQ5T5M9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNJQ5T5M9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNJQ5T5M9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNJQ5T5M9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNJQ5T5M9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNJQ5T5M9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNJQ5T5M9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNJQ5T5M9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNJQ5T5M9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNJQ5T5M9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNJQ5T5M9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNJQ5T5M9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNJQ5T5M9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNJQ5T5M9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNJQ5T5M9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNJQ5T5M9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNJQ5T5M9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNJQ5T5M9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNJQ5T5M9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNJQ5T5M9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNJQ5T5M9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNJQ5T5M9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNJQ5T5M9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNJQ5T5M9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNJQ5T5M9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNJQ5T5M9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNJQ5T5M9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCNJQ5T5M9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCNJQ5T5M9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNJQ5T5M9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNJQ5T5M9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNJQ5T5M9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNJQ5T5M9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNJQ5T5M9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNJQ5T5M9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNJQ5T5M9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNJQ5T5M9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNJQ5T5M9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNJQ5T5M9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNJQ5T5M9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNJQ5T5M9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNJQ5T5M9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNJQ5T5M9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNJQ5T5M9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNJQ5T5M9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNJQ5T5M9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNJQ5T5M9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNJQ5T5M9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNJQ5T5M9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNJQ5T5M9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNJQ5T5M9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNJQ5T5M9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNJQ5T5M9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNJQ5T5M9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNJQ5T5M9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNJQ5T5M9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNJQ5T5M9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNJQ5T5M9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNJQ5T5M9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNJQ5T5M9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
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