Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNYL2Q5T2Q4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNYL2Q5T2Q4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNYL2Q5T2Q4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNYL2Q5T2Q4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNYL2Q5T2Q4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms