Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
FRMPD1Q5SYB0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
FRMPD1Q5SYB0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
FRMPD1Q5SYB0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
FRMPD1Q5SYB0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
FRMPD1Q5SYB0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
FRMPD1Q5SYB0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
FRMPD1Q5SYB0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.12■■■■■ 4.01
FRMPD1Q5SYB0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
FRMPD1Q5SYB0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
FRMPD1Q5SYB0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
FRMPD1Q5SYB0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
FRMPD1Q5SYB0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
FRMPD1Q5SYB0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
FRMPD1Q5SYB0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
FRMPD1Q5SYB0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
FRMPD1Q5SYB0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
FRMPD1Q5SYB0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.03■■■■■ 4
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
FRMPD1Q5SYB0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
FRMPD1Q5SYB0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC40■■■■□ 3.99
FRMPD1Q5SYB0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
FRMPD1Q5SYB0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
FRMPD1Q5SYB0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
FRMPD1Q5SYB0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
FRMPD1Q5SYB0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
FRMPD1Q5SYB0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
FRMPD1Q5SYB0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
FRMPD1Q5SYB0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
FRMPD1Q5SYB0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
FRMPD1Q5SYB0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
FRMPD1Q5SYB0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
FRMPD1Q5SYB0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
FRMPD1Q5SYB0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
FRMPD1Q5SYB0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
FRMPD1Q5SYB0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
FRMPD1Q5SYB0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
FRMPD1Q5SYB0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
FRMPD1Q5SYB0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
FRMPD1Q5SYB0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
FRMPD1Q5SYB0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
FRMPD1Q5SYB0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
FRMPD1Q5SYB0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.98
FRMPD1Q5SYB0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
FRMPD1Q5SYB0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
FRMPD1Q5SYB0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
FRMPD1Q5SYB0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
FRMPD1Q5SYB0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
FRMPD1Q5SYB0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
FRMPD1Q5SYB0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
FRMPD1Q5SYB0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
FRMPD1Q5SYB0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
FRMPD1Q5SYB0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
FRMPD1Q5SYB0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
FRMPD1Q5SYB0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
FRMPD1Q5SYB0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
FRMPD1Q5SYB0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
FRMPD1Q5SYB0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
FRMPD1Q5SYB0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
FRMPD1Q5SYB0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
FRMPD1Q5SYB0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
FRMPD1Q5SYB0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
FRMPD1Q5SYB0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
FRMPD1Q5SYB0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
FRMPD1Q5SYB0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
FRMPD1Q5SYB0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
FRMPD1Q5SYB0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
FRMPD1Q5SYB0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
FRMPD1Q5SYB0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
FRMPD1Q5SYB0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
FRMPD1Q5SYB0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
FRMPD1Q5SYB0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
FRMPD1Q5SYB0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
FRMPD1Q5SYB0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
FRMPD1Q5SYB0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
FRMPD1Q5SYB0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
FRMPD1Q5SYB0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
FRMPD1Q5SYB0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
FRMPD1Q5SYB0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
FRMPD1Q5SYB0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
FRMPD1Q5SYB0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
FRMPD1Q5SYB0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
FRMPD1Q5SYB0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
FRMPD1Q5SYB0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
FRMPD1Q5SYB0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
FRMPD1Q5SYB0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC39.63■■■■□ 3.94
FRMPD1Q5SYB0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
FRMPD1Q5SYB0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
FRMPD1Q5SYB0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
FRMPD1Q5SYB0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms