Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COLEC12Q5KU26 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COLEC12Q5KU26 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COLEC12Q5KU26 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COLEC12Q5KU26 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COLEC12Q5KU26 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COLEC12Q5KU26 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COLEC12Q5KU26 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COLEC12Q5KU26 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COLEC12Q5KU26 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COLEC12Q5KU26 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COLEC12Q5KU26 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COLEC12Q5KU26 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COLEC12Q5KU26 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COLEC12Q5KU26 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COLEC12Q5KU26 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COLEC12Q5KU26 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COLEC12Q5KU26 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COLEC12Q5KU26 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COLEC12Q5KU26 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COLEC12Q5KU26 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COLEC12Q5KU26 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COLEC12Q5KU26 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COLEC12Q5KU26 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COLEC12Q5KU26 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COLEC12Q5KU26 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COLEC12Q5KU26 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COLEC12Q5KU26 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COLEC12Q5KU26 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COLEC12Q5KU26 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COLEC12Q5KU26 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms