Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP78Q5JTW2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP78Q5JTW2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP78Q5JTW2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP78Q5JTW2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP78Q5JTW2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP78Q5JTW2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP78Q5JTW2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP78Q5JTW2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CEP78Q5JTW2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP78Q5JTW2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP78Q5JTW2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP78Q5JTW2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP78Q5JTW2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP78Q5JTW2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP78Q5JTW2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP78Q5JTW2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP78Q5JTW2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP78Q5JTW2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP78Q5JTW2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP78Q5JTW2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP78Q5JTW2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP78Q5JTW2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP78Q5JTW2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP78Q5JTW2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP78Q5JTW2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP78Q5JTW2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP78Q5JTW2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP78Q5JTW2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP78Q5JTW2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP78Q5JTW2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP78Q5JTW2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP78Q5JTW2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP78Q5JTW2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP78Q5JTW2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP78Q5JTW2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP78Q5JTW2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP78Q5JTW2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP78Q5JTW2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP78Q5JTW2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP78Q5JTW2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CEP78Q5JTW2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms