Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM259Q4ZIN3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM259Q4ZIN3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM259Q4ZIN3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM259Q4ZIN3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM259Q4ZIN3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM259Q4ZIN3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM259Q4ZIN3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM259Q4ZIN3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM259Q4ZIN3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM259Q4ZIN3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM259Q4ZIN3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM259Q4ZIN3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM259Q4ZIN3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM259Q4ZIN3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM259Q4ZIN3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM259Q4ZIN3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM259Q4ZIN3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM259Q4ZIN3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM259Q4ZIN3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM259Q4ZIN3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM259Q4ZIN3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM259Q4ZIN3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM259Q4ZIN3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM259Q4ZIN3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM259Q4ZIN3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM259Q4ZIN3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM259Q4ZIN3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM259Q4ZIN3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM259Q4ZIN3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM259Q4ZIN3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM259Q4ZIN3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM259Q4ZIN3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM259Q4ZIN3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM259Q4ZIN3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM259Q4ZIN3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM259Q4ZIN3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM259Q4ZIN3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM259Q4ZIN3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM259Q4ZIN3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM259Q4ZIN3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM259Q4ZIN3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM259Q4ZIN3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM259Q4ZIN3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM259Q4ZIN3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM259Q4ZIN3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM259Q4ZIN3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM259Q4ZIN3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM259Q4ZIN3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms