Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HFEQ30201 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HFEQ30201 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HFEQ30201 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HFEQ30201 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HFEQ30201 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HFEQ30201 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HFEQ30201 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HFEQ30201 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HFEQ30201 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HFEQ30201 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HFEQ30201 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HFEQ30201 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HFEQ30201 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HFEQ30201 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HFEQ30201 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HFEQ30201 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HFEQ30201 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HFEQ30201 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HFEQ30201 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HFEQ30201 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HFEQ30201 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HFEQ30201 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HFEQ30201 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HFEQ30201 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HFEQ30201 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HFEQ30201 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HFEQ30201 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HFEQ30201 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HFEQ30201 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HFEQ30201 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HFEQ30201 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HFEQ30201 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HFEQ30201 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HFEQ30201 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HFEQ30201 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HFEQ30201 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HFEQ30201 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HFEQ30201 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HFEQ30201 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HFEQ30201 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HFEQ30201 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HFEQ30201 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HFEQ30201 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HFEQ30201 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HFEQ30201 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HFEQ30201 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HFEQ30201 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HFEQ30201 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HFEQ30201 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HFEQ30201 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HFEQ30201 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HFEQ30201 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HFEQ30201 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HFEQ30201 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HFEQ30201 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HFEQ30201 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HFEQ30201 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HFEQ30201 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HFEQ30201 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HFEQ30201 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HFEQ30201 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HFEQ30201 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HFEQ30201 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HFEQ30201 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HFEQ30201 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HFEQ30201 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HFEQ30201 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HFEQ30201 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HFEQ30201 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HFEQ30201 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HFEQ30201 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HFEQ30201 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HFEQ30201 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HFEQ30201 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HFEQ30201 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HFEQ30201 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HFEQ30201 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HFEQ30201 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HFEQ30201 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HFEQ30201 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HFEQ30201 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HFEQ30201 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HFEQ30201 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HFEQ30201 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HFEQ30201 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HFEQ30201 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HFEQ30201 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HFEQ30201 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HFEQ30201 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HFEQ30201 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HFEQ30201 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HFEQ30201 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HFEQ30201 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HFEQ30201 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HFEQ30201 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HFEQ30201 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HFEQ30201 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HFEQ30201 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HFEQ30201 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms