Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MICBQ29980 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MICBQ29980 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MICBQ29980 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MICBQ29980 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MICBQ29980 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MICBQ29980 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MICBQ29980 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MICBQ29980 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MICBQ29980 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MICBQ29980 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MICBQ29980 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MICBQ29980 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MICBQ29980 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MICBQ29980 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MICBQ29980 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MICBQ29980 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MICBQ29980 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MICBQ29980 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MICBQ29980 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MICBQ29980 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MICBQ29980 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MICBQ29980 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MICBQ29980 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MICBQ29980 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MICBQ29980 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MICBQ29980 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MICBQ29980 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MICBQ29980 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICBQ29980 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICBQ29980 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICBQ29980 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICBQ29980 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MICBQ29980 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICBQ29980 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICBQ29980 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICBQ29980 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICBQ29980 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICBQ29980 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICBQ29980 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICBQ29980 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICBQ29980 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICBQ29980 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICBQ29980 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICBQ29980 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICBQ29980 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MICBQ29980 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MICBQ29980 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MICBQ29980 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MICBQ29980 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MICBQ29980 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MICBQ29980 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MICBQ29980 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MICBQ29980 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MICBQ29980 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MICBQ29980 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MICBQ29980 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MICBQ29980 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MICBQ29980 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MICBQ29980 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MICBQ29980 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICBQ29980 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICBQ29980 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICBQ29980 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICBQ29980 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICBQ29980 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICBQ29980 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICBQ29980 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICBQ29980 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MICBQ29980 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MICBQ29980 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICBQ29980 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICBQ29980 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MICBQ29980 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MICBQ29980 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MICBQ29980 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICBQ29980 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICBQ29980 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICBQ29980 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICBQ29980 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICBQ29980 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICBQ29980 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICBQ29980 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MICBQ29980 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MICBQ29980 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MICBQ29980 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MICBQ29980 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MICBQ29980 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MICBQ29980 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MICBQ29980 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MICBQ29980 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MICBQ29980 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MICBQ29980 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MICBQ29980 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MICBQ29980 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MICBQ29980 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MICBQ29980 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MICBQ29980 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MICBQ29980 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MICBQ29980 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms