Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SWI5Q1ZZU3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWI5Q1ZZU3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWI5Q1ZZU3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWI5Q1ZZU3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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