Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NTRK2Q16620 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK2Q16620 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NTRK2Q16620 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NTRK2Q16620 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NTRK2Q16620 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NTRK2Q16620 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTRK2Q16620 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTRK2Q16620 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTRK2Q16620 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NTRK2Q16620 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK2Q16620 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK2Q16620 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK2Q16620 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK2Q16620 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NTRK2Q16620 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NTRK2Q16620 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NTRK2Q16620 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTRK2Q16620 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
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