Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB1Q16558 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB1Q16558 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB1Q16558 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB1Q16558 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNMB1Q16558 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMB1Q16558 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMB1Q16558 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNMB1Q16558 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMB1Q16558 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMB1Q16558 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNMB1Q16558 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMB1Q16558 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNMB1Q16558 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMB1Q16558 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMB1Q16558 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNMB1Q16558 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMB1Q16558 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMB1Q16558 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMB1Q16558 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMB1Q16558 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMB1Q16558 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMB1Q16558 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNMB1Q16558 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNMB1Q16558 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNMB1Q16558 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNMB1Q16558 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
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