Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USF2Q15853 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USF2Q15853 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USF2Q15853 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
USF2Q15853 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USF2Q15853 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USF2Q15853 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USF2Q15853 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USF2Q15853 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USF2Q15853 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USF2Q15853 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USF2Q15853 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USF2Q15853 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USF2Q15853 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USF2Q15853 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USF2Q15853 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USF2Q15853 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USF2Q15853 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USF2Q15853 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USF2Q15853 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USF2Q15853 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USF2Q15853 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USF2Q15853 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USF2Q15853 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USF2Q15853 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USF2Q15853 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USF2Q15853 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USF2Q15853 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USF2Q15853 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USF2Q15853 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USF2Q15853 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USF2Q15853 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USF2Q15853 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USF2Q15853 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USF2Q15853 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USF2Q15853 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USF2Q15853 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USF2Q15853 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
USF2Q15853 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USF2Q15853 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
USF2Q15853 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USF2Q15853 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USF2Q15853 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USF2Q15853 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USF2Q15853 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USF2Q15853 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USF2Q15853 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USF2Q15853 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USF2Q15853 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USF2Q15853 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USF2Q15853 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USF2Q15853 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USF2Q15853 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USF2Q15853 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USF2Q15853 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USF2Q15853 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USF2Q15853 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
USF2Q15853 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USF2Q15853 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USF2Q15853 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USF2Q15853 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USF2Q15853 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USF2Q15853 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USF2Q15853 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USF2Q15853 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USF2Q15853 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USF2Q15853 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USF2Q15853 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USF2Q15853 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USF2Q15853 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USF2Q15853 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USF2Q15853 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USF2Q15853 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USF2Q15853 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USF2Q15853 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USF2Q15853 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USF2Q15853 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USF2Q15853 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USF2Q15853 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USF2Q15853 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USF2Q15853 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USF2Q15853 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USF2Q15853 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USF2Q15853 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USF2Q15853 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USF2Q15853 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USF2Q15853 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USF2Q15853 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USF2Q15853 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USF2Q15853 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USF2Q15853 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USF2Q15853 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USF2Q15853 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USF2Q15853 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USF2Q15853 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USF2Q15853 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USF2Q15853 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USF2Q15853 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USF2Q15853 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USF2Q15853 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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