Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAMP3Q15836 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP3Q15836 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP3Q15836 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP3Q15836 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP3Q15836 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP3Q15836 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP3Q15836 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP3Q15836 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP3Q15836 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP3Q15836 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP3Q15836 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP3Q15836 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP3Q15836 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP3Q15836 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP3Q15836 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP3Q15836 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP3Q15836 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP3Q15836 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP3Q15836 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP3Q15836 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAMP3Q15836 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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