Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHRNA2Q15822 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHRNA2Q15822 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHRNA2Q15822 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHRNA2Q15822 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHRNA2Q15822 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHRNA2Q15822 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CHRNA2Q15822 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CHRNA2Q15822 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CHRNA2Q15822 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CHRNA2Q15822 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CHRNA2Q15822 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CHRNA2Q15822 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CHRNA2Q15822 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CHRNA2Q15822 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHRNA2Q15822 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHRNA2Q15822 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHRNA2Q15822 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHRNA2Q15822 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
CHRNA2Q15822 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHRNA2Q15822 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHRNA2Q15822 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHRNA2Q15822 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CHRNA2Q15822 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CHRNA2Q15822 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CHRNA2Q15822 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CHRNA2Q15822 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHRNA2Q15822 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHRNA2Q15822 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHRNA2Q15822 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHRNA2Q15822 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHRNA2Q15822 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHRNA2Q15822 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
CHRNA2Q15822 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
CHRNA2Q15822 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHRNA2Q15822 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHRNA2Q15822 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CHRNA2Q15822 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CHRNA2Q15822 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CHRNA2Q15822 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CHRNA2Q15822 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CHRNA2Q15822 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CHRNA2Q15822 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CHRNA2Q15822 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHRNA2Q15822 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CHRNA2Q15822 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CHRNA2Q15822 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHRNA2Q15822 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHRNA2Q15822 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHRNA2Q15822 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHRNA2Q15822 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHRNA2Q15822 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
CHRNA2Q15822 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CHRNA2Q15822 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CHRNA2Q15822 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CHRNA2Q15822 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHRNA2Q15822 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CHRNA2Q15822 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CHRNA2Q15822 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHRNA2Q15822 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHRNA2Q15822 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHRNA2Q15822 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CHRNA2Q15822 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CHRNA2Q15822 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHRNA2Q15822 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CHRNA2Q15822 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHRNA2Q15822 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHRNA2Q15822 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CHRNA2Q15822 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHRNA2Q15822 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CHRNA2Q15822 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHRNA2Q15822 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHRNA2Q15822 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHRNA2Q15822 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHRNA2Q15822 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CHRNA2Q15822 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CHRNA2Q15822 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms