Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC1A5Q15758 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC1A5Q15758 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC1A5Q15758 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC1A5Q15758 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC1A5Q15758 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC1A5Q15758 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC1A5Q15758 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC1A5Q15758 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A5Q15758 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A5Q15758 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A5Q15758 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC1A5Q15758 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC1A5Q15758 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC1A5Q15758 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC1A5Q15758 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC1A5Q15758 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC1A5Q15758 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A5Q15758 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A5Q15758 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A5Q15758 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC1A5Q15758 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC1A5Q15758 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A5Q15758 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A5Q15758 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A5Q15758 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A5Q15758 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A5Q15758 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A5Q15758 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC1A5Q15758 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC1A5Q15758 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC1A5Q15758 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A5Q15758 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A5Q15758 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A5Q15758 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A5Q15758 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC1A5Q15758 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC1A5Q15758 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A5Q15758 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A5Q15758 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A5Q15758 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A5Q15758 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A5Q15758 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A5Q15758 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A5Q15758 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC1A5Q15758 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC1A5Q15758 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC1A5Q15758 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC1A5Q15758 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC1A5Q15758 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A5Q15758 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC1A5Q15758 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC1A5Q15758 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC1A5Q15758 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC1A5Q15758 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC1A5Q15758 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A5Q15758 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A5Q15758 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A5Q15758 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A5Q15758 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A5Q15758 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC1A5Q15758 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC1A5Q15758 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC1A5Q15758 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC1A5Q15758 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC1A5Q15758 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A5Q15758 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms