Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERC1Q15751 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERC1Q15751 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC1Q15751 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC1Q15751 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC1Q15751 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC1Q15751 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC1Q15751 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERC1Q15751 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERC1Q15751 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC1Q15751 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERC1Q15751 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC1Q15751 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERC1Q15751 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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