Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SKIV2LQ15477 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SKIV2LQ15477 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SKIV2LQ15477 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SKIV2LQ15477 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SKIV2LQ15477 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SKIV2LQ15477 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKIV2LQ15477 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKIV2LQ15477 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKIV2LQ15477 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKIV2LQ15477 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SKIV2LQ15477 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SKIV2LQ15477 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SKIV2LQ15477 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SKIV2LQ15477 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SKIV2LQ15477 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SKIV2LQ15477 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SKIV2LQ15477 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SKIV2LQ15477 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SKIV2LQ15477 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SKIV2LQ15477 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SKIV2LQ15477 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SKIV2LQ15477 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SKIV2LQ15477 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SKIV2LQ15477 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SKIV2LQ15477 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SKIV2LQ15477 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKIV2LQ15477 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKIV2LQ15477 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SKIV2LQ15477 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKIV2LQ15477 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SKIV2LQ15477 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKIV2LQ15477 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SKIV2LQ15477 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SKIV2LQ15477 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SKIV2LQ15477 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SKIV2LQ15477 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SKIV2LQ15477 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SKIV2LQ15477 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SKIV2LQ15477 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SKIV2LQ15477 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SKIV2LQ15477 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SKIV2LQ15477 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SKIV2LQ15477 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKIV2LQ15477 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKIV2LQ15477 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKIV2LQ15477 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SKIV2LQ15477 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SKIV2LQ15477 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SKIV2LQ15477 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SKIV2LQ15477 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SKIV2LQ15477 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SKIV2LQ15477 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SKIV2LQ15477 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKIV2LQ15477 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKIV2LQ15477 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SKIV2LQ15477 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SKIV2LQ15477 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SKIV2LQ15477 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SKIV2LQ15477 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SKIV2LQ15477 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SKIV2LQ15477 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKIV2LQ15477 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKIV2LQ15477 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKIV2LQ15477 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SKIV2LQ15477 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SKIV2LQ15477 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SKIV2LQ15477 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SKIV2LQ15477 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SKIV2LQ15477 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKIV2LQ15477 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKIV2LQ15477 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKIV2LQ15477 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SKIV2LQ15477 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SKIV2LQ15477 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKIV2LQ15477 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKIV2LQ15477 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SKIV2LQ15477 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKIV2LQ15477 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKIV2LQ15477 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKIV2LQ15477 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SKIV2LQ15477 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SKIV2LQ15477 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SKIV2LQ15477 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SKIV2LQ15477 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SKIV2LQ15477 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SKIV2LQ15477 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SKIV2LQ15477 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SKIV2LQ15477 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SKIV2LQ15477 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SKIV2LQ15477 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SKIV2LQ15477 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SKIV2LQ15477 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SKIV2LQ15477 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SKIV2LQ15477 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SKIV2LQ15477 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SKIV2LQ15477 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SKIV2LQ15477 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SKIV2LQ15477 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SKIV2LQ15477 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms