Protein–RNA interactions for Protein: Q15287

RNPS1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1Q15287 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RNPS1Q15287 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNPS1Q15287 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNPS1Q15287 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNPS1Q15287 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNPS1Q15287 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNPS1Q15287 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNPS1Q15287 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNPS1Q15287 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNPS1Q15287 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNPS1Q15287 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNPS1Q15287 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNPS1Q15287 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNPS1Q15287 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNPS1Q15287 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNPS1Q15287 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNPS1Q15287 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNPS1Q15287 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNPS1Q15287 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNPS1Q15287 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNPS1Q15287 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNPS1Q15287 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNPS1Q15287 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNPS1Q15287 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RNPS1Q15287 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNPS1Q15287 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNPS1Q15287 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNPS1Q15287 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNPS1Q15287 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNPS1Q15287 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNPS1Q15287 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNPS1Q15287 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNPS1Q15287 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNPS1Q15287 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNPS1Q15287 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNPS1Q15287 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNPS1Q15287 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNPS1Q15287 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNPS1Q15287 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNPS1Q15287 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNPS1Q15287 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNPS1Q15287 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNPS1Q15287 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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