Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB35Q15286 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB35Q15286 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB35Q15286 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB35Q15286 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB35Q15286 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB35Q15286 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB35Q15286 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB35Q15286 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB35Q15286 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB35Q15286 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB35Q15286 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB35Q15286 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB35Q15286 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB35Q15286 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB35Q15286 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB35Q15286 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB35Q15286 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB35Q15286 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB35Q15286 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB35Q15286 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB35Q15286 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB35Q15286 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB35Q15286 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB35Q15286 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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