Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF1Q14990 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODF1Q14990 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF1Q14990 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF1Q14990 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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